Profesor: 

• Paulino Gómez Puertas. CBMSO. <pagomez@cbm.uam.es>

<http://www.cbm.uam.es/bioweb>

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• Introducción.

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• Estructura de proteínas. Comparación de estructuras. Bases de datos. Visualización. 
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• Alineamientos de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas. Búsqueda en bases de datos de secuencias Alineamiento múltiple de secuencias. Extracción de información de alineamientos de secuencia: patrones, perfiles y dominios.
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• Predicción de estructura de proteínas. Métodos ab initio. Predicción de características 1D. Predicción de estructura 3D mediante modelado por homología y reconocimiento de plegamiento. Sistemas automáticos de predicción.
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• Proteínas: relaciones estructura-actividad. Predicción de interacciones proteína-sustrato y proteína-proteína. Docking in silico.
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• EJERCICIO DE CURSO: MODELADO DE PROTEÍNAS Y DOCKING DE LIGANDOS.

 
• ..Libros de texto:
• Lesk, A.M. "Introduction to bioinformatics" 2dn Ed., Oxford University Press, 2005.  <http://www.oup.com/uk/orc/bin/9780199277872/>
• Claverie, J-M & Notredame, C. "Bioinformatics for Dummies"  2nd. Ed.Wiley Publishing, INC. 2006. <http://www.dummies.com/WileyCDA/DummiesTitle/productCd-0470089857.html>
• Mount, D. " Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis". CSHL Press, 2004.  <http://www.bioinformaticsonline.org/>
 
• Enlaces de interés:

• http://www.ebi.ac.uk/2can/tutorials/index.html
• http://www.s-star.org/lectures.html...